Les algues utilisées pour diagnostiquer la qualité de l'eau sont des algues microscopiques vivant sur les cailloux et appelées diatomées. Elles sont récoltées à l'aide d'une brosse spéciale dans chaque station 2 fois par année. La méthode utilisée pour déterminer la qualité de l'eau est l'indice suisse des diatomées (DI-CH). Suivant la sensibilité à la pollution des espèces récoltées et leur valeur bioindicatrice, une note de 1 à 8 est attribuée à chaque station.

La note est répartie en 5 classes:

1.0 - 3.49 Très bonne
3.5 - 4.49 Bonne
4.5 - 5.49 Moyenne
5.5 - 6.49 Médiocre
6.5 - 8.00 Mauvaise

Cette couche représente les moyennes annuelles des dernières campagnes sur les différentes stations.