Des contrôles bactériologiques sont effectués périodiquement sur l'ensemble des rivières genevoises. Ils ont pour but de dénombrer les Escherichia coli, une bactérie indicatrice de pollution fécale. La méthode employée est celle qui est habituellement appliquée pour la surveillance de la qualité hygiénique des eaux de baignade (OFSP et al., 1990).

Cette couche représente les moyennes annuels des dernières campagnes sur les différentes stations.

L'interprétation des résultats se base sur la grille d'appréciation de l'état sanitaire des cours d'eau du canton de Genève (Service de l'écologie de l'eau, 2007). Les valeurs sont exprimées en UFC/ml (Unités Formant Colonie) et sont réparties en 5 classes, Très bonne, Bonne, Moyenne, Médiocre, Mauvaise.